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KAPA 人類基因組DNA定量及QC試劑盒
產(chǎn)品名稱：KAPA 人類基因組DNA定量及QC試劑盒產(chǎn)品貨號：KK4960產(chǎn)品規(guī)格：300反應(yīng)
產(chǎn)品介紹：
KAPA hgDNA定量&QC試劑盒，是基于SYBR Green I染料法優(yōu)化的高質(zhì)量qPCR檢測試劑盒，包含KAPA SYBR® FAST qPCR Master Mix預(yù)先稀釋的一系列DNA標(biāo)準(zhǔn)品，以及針對于人類基因組單拷貝的高度保守區(qū)域的不同位點所設(shè)計的引物預(yù)混液。最小片段所對應(yīng)的引物，用于獲得絕對定量的結(jié)果，而額外的引物，用于獲得在DNA樣本中可擴增模板量(質(zhì)量高的核酸片段)的信息。這個試劑盒由此所產(chǎn)生的質(zhì)量分?jǐn)?shù)(即Q-ratios)，可以用于預(yù)測文庫的產(chǎn)量，或者對于如FFPE DNA這類樣本質(zhì)量變化很大的樣本的工作流程進(jìn)行調(diào)整。
產(chǎn)品名稱：KAPA 人類基因組DNA定量及QC試劑盒
產(chǎn)品貨號：KK4960
產(chǎn)品特點：
在單次檢測中，同時評估樣本量以及樣本質(zhì)量
可以將質(zhì)量分?jǐn)?shù)(Q-ratios)與測序相關(guān)指標(biāo)相關(guān)聯(lián)
高性能的KAPA SYBR FAST qPCR Master Mix
預(yù)先稀釋好的DNA標(biāo)準(zhǔn)品以及可以直接使用的引物
多功能、易于自動化的工作流程
產(chǎn)品原理：
一組DNA標(biāo)準(zhǔn)品，使用三對不同引物，用于產(chǎn)生(最多)三組標(biāo)準(zhǔn)曲線。這三對引物的擴增目標(biāo)，位于某高度保守、單拷貝的人類基因組位點，其大小分別為41 bp, 129 bp以及305 bp。41 bp檢測用于DNA樣品的絕對定量。對于評估DNA質(zhì)量，使用129 bp和/或305 bp引物預(yù)混液生成標(biāo)準(zhǔn)曲線并且檢測樣本。由于低質(zhì)量的DNA樣本的長片段擴增效率會大幅度降低，相對的DNA質(zhì)量可以通過41 bp檢測的濃度，對于129 bp或者305 bp檢測的濃度進(jìn)行均一化，或者在此DNA樣本中可被擴增的物質(zhì)的量來進(jìn)行推測。這種通過標(biāo)準(zhǔn)化產(chǎn)生的質(zhì)量分?jǐn)?shù)(值介于0和1之間)，可以用于指示DNA的質(zhì)量，或者在此DNA樣本中可被擴增的物質(zhì)的量。
產(chǎn)品優(yōu)勢：
對于稀釋后的DNA樣本進(jìn)行絕對定量
用附加的引物進(jìn)行定量分析，獲得的Q-ratio用于指示樣本的質(zhì)量
使用預(yù)期：
文庫的轉(zhuǎn)化率，為在Illumina測序平臺上進(jìn)行靶向重測序而制備
分別從樣本質(zhì)量參差的80-100 ng FFPE DNA樣本(橙色)和商用人類基因組DNA(灰色)，使用KAPA LTP文庫構(gòu)建試劑盒來構(gòu)建測序文庫。FFPE DNA樣本在用Covaris打斷之前，用KAPA hgDNA定量&QC試劑盒進(jìn)行檢測，然后按照Q-ratios(DNA質(zhì)量)沿X軸升序排列。Q-ratios如圖中標(biāo)注。片段化的DNA(平均大小在180 bp左右)在建庫之前，用Qubit® HS dsDNA (Life Technologies) 進(jìn)行定量；在連接接頭、形成文庫分子之后，使用基于qPCR的KAPA文庫定量試劑盒進(jìn)行定量。結(jié)果顯示，F(xiàn)FPE樣本的文庫轉(zhuǎn)化率(Conversion Rate，起始DNA分子轉(zhuǎn)化成連接有接頭的文庫分子的百分比，%)明顯低于高質(zhì)量的DNA樣本，使得FFPE樣本的文庫分子多樣性受到限制，并且需要在文庫擴增步驟中采取更多的循環(huán)數(shù)才能得到足夠多的文庫分子進(jìn)行靶標(biāo)捕獲，從而使FFPE樣本的文庫的重復(fù)率(duplication rate) 更高，靶標(biāo)覆蓋率(target coverage)更低。
產(chǎn)品名稱：KAPA 人類基因組DNA定量及QC試劑盒
產(chǎn)品貨號：KK4960
產(chǎn)品訂購信息
品牌 貨號 名稱 規(guī)格
KAPA KK4960 KAPA hgDNA定量和質(zhì)控試劑盒 300反應(yīng)
關(guān)于公司：
Kapa Biosystems位于美國馬薩諸塞州威爾明頓，是一家蛋白質(zhì)工程專家及基因組學(xué)工具供應(yīng)商，致力于研發(fā)、生產(chǎn)下一代測序（NGS）所需的生物酶及相關(guān)試劑，該公司基于直接分子進(jìn)化平臺開發(fā)的產(chǎn)品已被廣泛用于DNA擴增、測序、基因組學(xué)研究、分子診斷等領(lǐng)域。
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