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KAPA hgDNA定量及QC試劑盒
產(chǎn)品名稱：KAPA hgDNA定量及QC試劑盒產(chǎn)品貨號：KK4960產(chǎn)品規(guī)格：300反應(yīng)
產(chǎn)品介紹：
KAPA hgDNA定量&QC試劑盒，包含人類基因組DNA樣品NGS文庫構(gòu)建前，所有基于qPCR定量及質(zhì)量評估的試劑。
KAPA hgDNA定量&QC試劑盒，是基于SYBR Green I染料法優(yōu)化的高質(zhì)量qPCR檢測試劑盒，包含KAPA SYBR® FAST qPCR Master Mix預(yù)先稀釋的一系列DNA標準品，以及針對于人類基因組單拷貝的高度保守區(qū)域的不同位點所設(shè)計的引物預(yù)混液。最小片段所對應(yīng)的引物，用于獲得絕對定量的結(jié)果，而額外的引物，用于獲得在DNA樣本中可擴增模板量(質(zhì)量高的核酸片段)的信息。這個試劑盒由此所產(chǎn)生的質(zhì)量分數(shù)(即Q-ratios)，可以用于預(yù)測文庫的產(chǎn)量，或者對于如FFPE DNA這類樣本質(zhì)量變化很大的樣本的工作流程進行調(diào)整。
產(chǎn)品名稱：KAPA hgDNA定量及QC試劑盒
產(chǎn)品貨號：KK4960
產(chǎn)品特點：
在單次檢測中，同時評估樣本量以及樣本質(zhì)量
可以將質(zhì)量分數(shù)(Q-ratios)與測序相關(guān)指標相關(guān)聯(lián)
高性能的KAPA SYBR FAST qPCR Master Mix
預(yù)先稀釋好的DNA標準品以及可以直接使用的引物
多功能、易于自動化的工作流程
產(chǎn)品原理：
一組DNA標準品，使用三對不同引物，用于產(chǎn)生(最多)三組標準曲線。這三對引物的擴增目標，位于某高度保守、單拷貝的人類基因組位點，其大小分別為41 bp, 129 bp以及305 bp。41 bp檢測用于DNA樣品的絕對定量。對于評估DNA質(zhì)量，使用129 bp和/或305 bp引物預(yù)混液生成標準曲線并且檢測樣本。由于低質(zhì)量的DNA樣本的長片段擴增效率會大幅度降低，相對的DNA質(zhì)量可以通過41 bp檢測的濃度，對于129 bp或者305 bp檢測的濃度進行均一化，或者在此DNA樣本中可被擴增的物質(zhì)的量來進行推測。這種通過標準化產(chǎn)生的質(zhì)量分數(shù)(值介于0和1之間)，可以用于指示DNA的質(zhì)量，或者在此DNA樣本中可被擴增的物質(zhì)的量。
產(chǎn)品優(yōu)勢：
指示樣品是否有足夠的量以及質(zhì)量來成功構(gòu)建文庫
未通過質(zhì)控的樣本，不再進行后續(xù)文庫構(gòu)建以及測序步驟，從而節(jié)約時間和精力
使用預(yù)期：
Q129/41 比值和測序中的關(guān)鍵指標（如重復(fù)率）具有相關(guān)性
從250 ng Covaris打斷的FFPE DNA樣本(n=14)和對照組DNA(分別從培養(yǎng)細胞、新鮮冰凍樣本和血液中提取，n=6)，進行手動文庫構(gòu)建。樣本按照Q129/41-比例升序在x軸上從左至右排列(FFPE樣本用黃色表示，對照組DNA用橙色表示)。文庫構(gòu)建采用的是NEBNext® 試劑(New England Biolabs)，其中靶標捕獲前和靶標捕獲后的擴增環(huán)節(jié)(10個循環(huán))采取KAPA HiFi 試劑盒。靶標捕獲使用的是定制的SeqCap EZ panel (300 genes,0.9 MB)。 在Illumina HiSeq平臺上進行了測序(2 x 100 bp)。FFPE樣本的平均靶標覆蓋率(藍色點)是對照組的四倍(1,247X, vs. 301X)，平均重復(fù)率(紅色點)是對照組的兩倍(75% vs. 38%)。Q129/41 比值 > 0.4 的FFPE樣本所產(chǎn)出的文庫能夠達到測序質(zhì)量要求。
產(chǎn)品訂購信息
產(chǎn)品名稱：KAPA hgDNA定量及QC試劑盒
產(chǎn)品貨號：KK4960
關(guān)于公司：
Kapa Biosystems位于美國馬薩諸塞州威爾明頓，是一家蛋白質(zhì)工程專家及基因組學(xué)工具供應(yīng)商，致力于研發(fā)、生產(chǎn)下一代測序（NGS）所需的生物酶及相關(guān)試劑，該公司基于直接分子進化平臺開發(fā)的產(chǎn)品已被廣泛用于DNA擴增、測序、基因組學(xué)研究、分子診斷等領(lǐng)域。
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